一、捐血篩檢存在「空窗期」之問題，為避免民眾因輸血而感染愛滋病毒、B型C型肝炎病毒，衛生署已自96年開始，陸續補助台灣血液基金會對輸血用之血液，實施血液核酸擴大檢驗篩檢（NAT）。為評估其效益，將從以下兩種對象優先辦理：
（一）首次之捐血者。
（二）以前有捐過血，但未曾接受血液核酸擴大檢驗篩檢（NAT）的捐血者。
二、台灣血液基金會已經從99年7月開始，利用基金會結餘款對輸血用之血液執行核酸擴大檢驗篩檢（NAT）約50萬人次/每年；另本局亦於99年度補（捐）助台灣血液基金會1500萬執行「供輸血用血液常規檢驗增加核酸擴大檢驗獎勵計畫」，將用NAT方式篩檢10萬捐血人次。