使用基因改造生物為材質，製造或加工而成的食品，就是基因改造食品。基因改造食品在市面上呈現的方式有以下三大類：
1.原料型態的食品：即食品本身就是基因改造生物，如耐除草劑的基因改造大豆。
2.初級加工型態的食品：例如由基因改造大豆經簡單加工磨成的豆漿。初級加工的食品還含有基因DNA成分，能輕易檢測出是否含有基因改造成分。
3.高度加工型態的食品：例如以基因改造大豆為原料，經複雜加工程序精緻純化的大豆油。高度加工後的食品通常已經不含完整的基因DNA成分，以目前的檢驗技術不易分辨出是否為基因改造食品。