⑴口服藥：藥物經由肝臟代謝，須檢測肝功能指數變化；有些藥物會和其他藥物產生交互作用，使用要小心，而有些藥物則不建議充血性心臟衰竭的患者使用。在肝功能檢查方面，必須在服藥前和服藥數週後各檢測一次。口服藥物的治療期：一天1次，手指甲感染需連續服用42天，腳趾甲則是84天。
⑵外用藥物：因為指甲板結構較難穿透，所以治療甲癬的藥劑有比較特別的指甲油劑，透過溶劑快速揮發的作用提升藥劑濃度、穿透指甲板殺黴菌，每週一次，腳趾甲需要持續9-12個月，怕吃藥或有禁忌症的人可選用此法。但每次擦新的藥劑前，必須先磨掉上週的藥膜。
⑶雷射：許多外國研究利用雷射的光熱效應殺黴菌、促進指甲生長速度，但療效不如上述兩類治療，若想自費嘗試請尋求合格的醫療機構治療。
⑷拔掉指甲：如果拔除指甲後，指甲生長環境仍充滿黴菌的話，結局仍是再復發，而且傷口照護是個問題。要注意的是，糖尿病、血液循環較差、凝血功能差的人不適用。

    治療甲癬時也要治療足癬，口服藥可兩者兼具，有些患者身上可能有不同部位受到黴菌感染，如：臀部、胯下、身體、四肢，若採用口服藥物治療可一網打盡。此外，日常生活要盡量保持患部乾爽，才能避免有利於黴菌生長的環境，進而幫助治療成功率。